نيروهاي مسلح ارمنستان در سال 1993 شهر آغدام را اشغال نموده، مسجد جمعه شهر را تحقير و ويران كرده و به عنوان محل نگهداري حيوانات از آن استفاده نموده اند.
درحال حاضر مسجد جمعه آغدام از طرف ارمنستان به قرارگاه نظامي تبديل شده است
